關(guān)于舉辦超高分辨質(zhì)譜Orbitrap Fusion Lumos在定量蛋白質(zhì)組學方向應用的培訓通知(76期)
為加強我校師生對大型科研儀器設(shè)備操作能力,掌握樣品制備及儀器使用技能,充分發(fā)揮大型儀器設(shè)備作用,提高使用效率,按照學校統(tǒng)一安排,生命科學大型儀器共享平臺于2023年11月12日舉辦超高分辨質(zhì)譜Orbitrap Fusion Lumos在蛋白質(zhì)組學方向應用培訓,現(xiàn)將有關(guān)事項通知如下:
一、培訓內(nèi)容
重點介紹超高分辨質(zhì)譜Orbitrap Fusion Lumos的基本操作,在定量蛋白質(zhì)組學方面的應用。包括蛋白組學實驗流程、定量蛋白質(zhì)組學的原理、應用以及數(shù)據(jù)分析等。
二、培訓時間
2023年11月12日
上午9:00-11:00 理論培訓 下午3:00-5:00 操作培訓
主講人:任美娟 輔助:劉耀
三、培訓地點
北校生命科學大型儀器共享平臺多媒體室(老昆蟲博物館一層)
四、具體要求
1、請各相關(guān)單位組織學生微信掃碼報名,限額60人,報滿為止。
聯(lián)系電話: 87092717
聯(lián)系人:任老師、劉老師
掃碼報名
培訓結(jié)束后,全程參加培訓的人員,由生命平臺統(tǒng)一發(fā)放培訓證書。
1、參加培訓人員應提前10分鐘到場,必須遵守學校和生命平臺的各項規(guī)章制度,接受生命平臺工作人員的管理,參加下午上機操作,需穿戴實驗服,并做好進入生命平臺登記記錄。
儀器簡介
三合一超高分辨組合式質(zhì)譜儀為Thermo Fisher生產(chǎn),主要包括四級桿質(zhì)量過濾器,雙壓線性離子阱和Orbitrap靜電場軌道肼質(zhì)量分析器,最高可達500000 FWHM的超高分辨能力(m/z 200),掃描速度可達20Hz,配有四種碎裂模式CID、HCD 、 ETD 和 EthcD。主要用于蛋白質(zhì)組學或目標蛋白質(zhì)研究,包括:高通量蛋白質(zhì)鑒定,蛋白質(zhì)相互作用鑒定,高通量蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析,目標蛋白質(zhì)監(jiān)測、驗證,使用標記或非標記方法進行蛋白質(zhì)組高通量相對定量(差異比較),或目標蛋白質(zhì)絕對定量,發(fā)現(xiàn)重要生理過程及疾病相關(guān)的生物標志物,尋找藥物作用靶點等。
Spectronaut軟件:
主要功能:Spectronaut是一款進行 DIA(Data-independent acquisition,數(shù)據(jù)非依賴采集)數(shù)據(jù)分析的軟件,為DIA數(shù)據(jù)的分析提供完整的解決方案,包括譜圖庫構(gòu)建、數(shù)據(jù)質(zhì)控、蛋白定量、統(tǒng)計分析、GO富集等
特性:
1.支持多個CPU核心同時計算
2.支持全自動高通量DDA,DIA數(shù)據(jù)搜索并構(gòu)建譜圖參考數(shù)據(jù)庫
3.支持Thermo、Sciex、Agilent、Bruker、Waters等質(zhì)譜公司數(shù)據(jù)
4.支持DIA, SWATH,SONAR等數(shù)據(jù)格式直接定性定量分析、匹配譜圖庫定量分析
5.滿足基于Java的完全可視化界面,流程化分析,所有分析模塊、結(jié)果查詢界面均集成在統(tǒng)一界面中
6.滿足支持輸出蛋白、肽段可視化報告,支持通用格式sne輸出,支持對接Skyline等軟件的專有格式輸出