關(guān)于生命平臺舉辦“定性及相對定量蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)解析應(yīng)用”培訓(xùn)通知
一、培訓(xùn)內(nèi)容
1.基于SpectroMine的DDA數(shù)據(jù)解析
2.基于Spectronaut的DIA數(shù)據(jù)解析
二、培訓(xùn)時間
2023年10月18日 上午9:00-12:00
下午2:00-4:00
三、培訓(xùn)地點
生命科學(xué)大型儀器共享平臺多媒體室（北校區(qū)老昆蟲博物館一層）
四、具體要求
1.請需要參加培訓(xùn)的師生微信掃碼報名，限額60人，報滿為止。
聯(lián)系人：李老師 任老師 聯(lián)系電話：87092717
掃一掃，立即報名
2.參加培訓(xùn)人員應(yīng)提前10分鐘到場，穿實驗服，遵守學(xué)校、生命平臺各項規(guī)章制度，接受生命平臺工作人員的管理，做好進入生命平臺登記記錄。
實驗室安全與條件保障處
2023年10月16日
軟件簡介
Spectronaut軟件：
主要功能：Spectronaut是一款進行 DIA（Data-independent acquisition，數(shù)據(jù)非依賴采集）數(shù)據(jù)分析的軟件，為DIA數(shù)據(jù)的分析提供完整的解決方案，包括譜圖庫構(gòu)建、數(shù)據(jù)質(zhì)控、蛋白定量、統(tǒng)計分析、GO富集等
特性：
1.支持多個CPU核心同時計算
2.支持全自動高通量DDA,DIA數(shù)據(jù)搜索并構(gòu)建譜圖參考數(shù)據(jù)庫
3.支持Thermo、Sciex、Agilent、Bruker、Waters等質(zhì)譜公司數(shù)據(jù)
4.支持DIA, SWATH,SONAR等數(shù)據(jù)格式直接定性定量分析、匹配譜圖庫定量分析
5.滿足基于Java的完全可視化界面，流程化分析，所有分析模塊、結(jié)果查詢界面均集成在統(tǒng)一界面中
6.滿足支持輸出蛋白、肽段可視化報告，支持通用格式sne輸出，支持對接Skyline等軟件的專有格式輸出
SpectroMine軟件：
主要功能：SpectroMine軟件能夠分析各類采集類型的質(zhì)譜數(shù)據(jù)，從定性、到DDA非標(biāo)以及各類報告離子定量數(shù)據(jù)的分析。
特性：
1. DIA,DDA和PRM數(shù)據(jù)的搜庫定性：支持對多種數(shù)據(jù)采集類型結(jié)果的同時分析。
2. 超快，支持超過1000個run的數(shù)據(jù)分析：創(chuàng)新的算法能夠大大節(jié)約內(nèi)存消耗，使得采用普通桌面電腦就能分析1000個以上的run，同時分析速度極快，一般5分鐘左右即可分析完畢一個2小時的Fusion DDA數(shù)據(jù)，1小時即能分析完一整套ITRAQ定量數(shù)據(jù)。
3. 高可信度的統(tǒng)計方法：支持從肽段到蛋白水平的FDR質(zhì)控。
4. 差異定量分析：基于非標(biāo)記（LFQ）、報告離子標(biāo)記（ITRAQ, TMT, EASI-TAG）的定量分析功能（DIA及PRM分析請使用Spectronaut和SpectroDive）。
5. 支持內(nèi)嵌GO分析：內(nèi)嵌GO分析及富集模塊可以快速發(fā)現(xiàn)相關(guān)功能變化。
SpectroDive軟件：
SpectroDive軟件是專門為靶向蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)（ PRM和MRM）的數(shù)據(jù)分析而開發(fā)的軟件。 此軟件整合了PRM/MRM完整工作流程：建立分析panel、 自動生成質(zhì)譜設(shè)置方法、 信號提取及定量。具備自動MS實驗設(shè)置、信號處理及分析，整合iRT校正，強大的峰打分系統(tǒng)，即時直觀的數(shù)據(jù)可視化，自定義報告，全自動數(shù)據(jù)質(zhì)控等強大功能。
特性：
1.支持分析下一代蛋白質(zhì)譜靶向驗證核心技術(shù)：PRM/MRM
2.具有無與倫比的優(yōu)勢： 超快計算速度，全面嚴(yán)格的質(zhì)控標(biāo)準(zhǔn)
3.簡單、 易用的用戶界面
4.支持自動生成方法文件，支持平行定量海量樣本